Selon la Cour des comptes, les coûts de la JDC sont maîtrisés. Elle les évalue de 116 à 118 millions d'euros, soit un montant légèrement supérieur à ce qui est calculé par la direction du service national (DSN).

La Cour des comptes conclut que cette journée constitue « une pièce maîtresse du lien Armée-Nation, et que, si l'on veut sauvegarder ou développer ce lien, il ne semble guère aisé de mettre en oeuvre une solution touchant autant de jeunes Français et qui ne soit pas plus coûteuse ».

Parmi ses recommandations pour améliorer le dispositif existant, cinq axes principaux suivants :

- améliorer l'évaluation des coûts complets de la JDC et l'information apportée au Parlement à leur sujet ;

- donner la priorité au contenu de la JDC ;

- mieux s'appuyer sur le parcours scolaire obligatoire pour recentrer la JDC sur l'esprit de défense ;

- s'attacher à faire participer tous les jeunes Français à la JDC ;

- suivre de manière personnalisée les jeunes en difficulté de lecture et les décrocheurs repérés lors de cette journée.